1977-1978 eğitim öğretim yılında Aşağı Döngel İlkokulu adıyla eğitime başlayan okulumuz , 1990-1991 eğitim öğretim yılında Döngel Barbaros İlköğretim Okulu adıyla eğitim öğretim vermeye başlamıştır. Bulunduğu belde adının Karşıyaka olarak isimlendirilmesi ve ünlü Türk denizcisi Barbaros Hayrettin Paşa’ya atfen ‘Karşıyaka Barbaros İlköğretim Okulu’ olarak değiştirilmiştir. 1990 yılında 2 kattan oluşan ilkokul binasına sonradan ilave bitişik 3 katlı ek bina yapılmıştır. 2016 yılına kadar okulumuzda 16 derslikte 21 şubede ortaokullar sabahçı, ilkokullar öğlenci olmak üzere ikili eğitim yapılmıştır. 2016 yılında Karşıyaka Barbaros Ortaokulu ,Şehit Yunus Emre Ezer ismiyle yeni binasına taşınmıştır. Karşıyaka Barbaros İlkokulu 2016 – 2020 yılları arasında mevcut binada tam gün eğitime devam etmiştir.
Mahallenin hızlı büyümesi ve gelişmesiyle göç alan bölge durumuna gelmiştir. Bu nedenle öğrenci sayılarında çok hızlı artışlar olmuştur. 2020 -2022 yıllarında ikili eğitime(sabahçı-öğlenci) geçilmiştir. Okul binasının deprem öncesi yapılmış olması, eski bina olması; öğrenci sayılarındaki artış ve bina kapasitenin yetersiz kalması nedeniyle 2022 yılında okul binası yıkılarak aynı alana yeni okul binası inşaatı başlamıştır. 2022-2023/2023-2024 eğitim öğretim yılında ve 2024-2025 eğitim öğretim yılı 1.döneminde Karşıyaka Tüpraş Mesleki ve Teknik Anadolu Lisesi binasında eğitim öğretime devam edilmiştir.
2024-2025 eğitim öğretim yılı 2. döneminde Karşıyaka Barbaros İlkokulu yeni binası tamamlanarak eğitim öğretime açılmıştır. Okulumuz 5450 m2 alan üzerine inşa edilmiş olup zemin giriş +3 katlıdır. 24 derslik, 1 anasınıfı, 1 fen atölyesi , 1 bilgisayar atölyesi ve 1 konferans salonundan oluşmaktadır.